溫州醫(yī)學院兒科學是國務院首批碩士學位授予點，1978年開始招收碩士生，2009年開始招收博士生，到目前為止已培養(yǎng)碩士生300余名。學科培養(yǎng)出一批活躍在國內(nèi)外兒科學界的優(yōu)秀人才如沈曉明、孫錕、陳超、林錦（美國)和趙偉（美國)等。本學科現(xiàn)有博士生導師3位，碩士生導師18位。
兒科學目前主要研究方向有兒科呼吸、新生兒、兒科心血管、兒童保健、兒童外科、兒科神經(jīng)康復和兒科腎病等。其中，兒科（呼吸)、圍產(chǎn)醫(yī)學和兒科康復科是浙江省醫(yī)學重點學科，兒童外科是浙江省醫(yī)學重點扶植學科，中西醫(yī)結(jié)合兒科（腎臟)是浙江省中醫(yī)藥重點扶持學科，兒科心血管、兒科神經(jīng)是院級重點學科。
兒科學2003年和2005年兩次被浙江省教育廳授予浙江省高校重點扶持學科，2006成為衛(wèi)生部�？漆t(yī)師培訓試點基地，學科基地為擁有450余張床位的溫州醫(yī)學院附屬育英兒童醫(yī)院，目前已成為浙南、閩北兒童醫(yī)療、保健中心。目前為中華醫(yī)學會兒科學分會呼吸學組副組長，浙江省小兒外科分會主任委員單位及中華醫(yī)學會小兒外科學分會腫瘤學組副組長單位醫(yī)學全在線搜集整,理m.zxtf.net.cn。國家食品藥品監(jiān)督管理局藥物臨床試驗基地（兒科呼吸)、浙江省兒科呼吸、感染和免疫學組組長單位，溫州醫(yī)學院兒科研究所和浙江省小兒呼吸疾病診療研究中心掛靠本學科。
學科現(xiàn)有高級職稱76人，具碩/博士學歷者62人，浙江省“151人才工程”8人，浙江省中青年學科帶頭人4人，4人獲浙江省高校青年教師資助。目前承擔包括國家自然科學基金（7項)，浙江省自然科學基金（12項)、浙江省科技廳項目（6項)在內(nèi)的各類課題90余項；近5年來20余項課題獲得各級獎項，其中浙江省政府科技進步獎5項；主編和參編學術專著18本；發(fā)表SCI收錄論文30余篇，中華系列論文120篇；入選《中華兒科雜志》發(fā)表論文最多單位獎（1978年至2006年，排名第11)�！秲嚎茖W》2004年被列入浙江省精品課程建設。
負責人李昌崇教授為中華醫(yī)學會兒科呼吸學組副組長，中華醫(yī)學會兒科學委員，浙江省高等學校教學名師，承擔國家自然科學基金4項，獲浙江省科學技術進步獎3項，發(fā)表SCI收錄、中華系列論文30余篇，主編《兒童支氣管哮喘基礎與臨床》（人民衛(wèi)生出版社，2010年)，擔任《兒科學》第七版（人民衛(wèi)生出版社)編委，國家自然科學基金委員會的評審專家，《中華兒科雜志》等10余本雜志編委或常務編委。
