1.DNA聚合酶Ⅰ:
DNA polⅠ是由一條多肽鏈組成,分子量為109KD。酶分子中含有一個(gè)Zn++,是聚合活性必須的。
大腸桿菌每個(gè)細(xì)胞中約有400個(gè)酶分子,每個(gè)酶分子每分鐘在37℃下能催化667個(gè)核苷酸參入到DNA鏈中,用枯草桿菌蛋白酶可將此酶水介成兩個(gè)片段,大片段分子量為76KD,通常稱為klenow片段,小片段為34KD。大小片段具有不同的酶活性。
(1)DNA聚合酶的5′→3′聚合活性:
這是DNA聚合酶最主要的活性,按模板DNA上的核苷酸順序,將互補(bǔ)的dNTP逐個(gè)加到引物RNA3′桹H末端,并促進(jìn)3′桹H與dNTP的5′桺O4形成磷酸二酯鍵,酶的專一性表現(xiàn)為新進(jìn)入的dNTP必須與模板DNA堿基配對(duì)時(shí)才有催化作用,5′→3′聚合活性存在于klenow片段上(圖16-9和圖16-10)。
圖16-10 DNA聚合酶催化的DNA鏈延長(zhǎng)
(2)DNA聚合酶的3′→5′外切核酸酶活性:
這種酶活性的主要功能是從3′→5′方向識(shí)別并切除DNA生長(zhǎng)鏈末端與模板DNA不配對(duì)而游離的核苷酸,這種功能稱為校對(duì)功能,這是保證其聚合作用的正確性不可缺少的,因此對(duì)于DNA復(fù)制中極高的保真性是至關(guān)重要的。
(3)DNA聚合酶的5′→3′外切核酸酶活性:
這種酶活性是從DNA鏈的5′端向3′末端水解已配對(duì)的核苷酸,本質(zhì)是切斷磷酸二酯鍵,每次能切除10個(gè)核苷酸。因此,這種酶活性在DNA損傷的修復(fù)中可能起重要作用,對(duì)完成的DNA片段去除5′端的RNA引物也是必須的。
DNA polⅠ的5′→3′聚合活性和5′→3′外切酶活性協(xié)同作用,可以使DNA一條鏈上的切口從5′→3′方向移動(dòng),這種反應(yīng)叫做缺刻平移(nick translation),利用此反應(yīng)可在體外對(duì)DNA片段進(jìn)行放射性磷(α-32PdNTP)的標(biāo)記制成探針(probe),進(jìn)行核酸的分子雜交實(shí)驗(yàn),是現(xiàn)代分子生物學(xué)的一項(xiàng)重要技術(shù)(圖16-11)。
圖16-11 缺刻平移標(biāo)記DNA探針
許多實(shí)驗(yàn)證實(shí)DNA polⅠ并不是DNA復(fù)制過程中的主要酶,它的作用主要與DNA損傷后的修復(fù)有關(guān)。
2.DNA聚合酶Ⅱ(DNA polⅡ)
此酶分子量為120KD,每個(gè)細(xì)胞約有100個(gè)酶分子,但活性只有DNa polⅠ的5%,它具有5′→3′聚合活性和3′→5′外切活性,而沒有5′→3′外切活性,它的作用可能與DNA損傷修復(fù)有關(guān)。醫(yī)學(xué)全在線www.med126.com
3.DNA聚合酶Ⅲ(DNA polⅢ)
圖16-12 DNA聚合酶Ⅲ催化先導(dǎo)鏈和隨從的合成
這是在DNA復(fù)制過程中起主要作用的聚合酶,它是由一個(gè)多亞基組成的蛋白質(zhì)分子,其分子量>600kDa整個(gè)酶分子形成一個(gè)不對(duì)稱的二聚體,每個(gè)大腸桿菌細(xì)胞中只有10?0個(gè)酶分子,但催化dNTP參入DNA鏈的速率卻是最快的,約為9000核苷酸/每分鐘/每個(gè)酶分子。這也證明DNa polⅢ是DNA復(fù)制過程中主要發(fā)揮作用的酶。在大腸桿菌染色體DNA進(jìn)行復(fù)制時(shí),DNA聚合酶Ⅲ全酶并不是單獨(dú)起作用的,而是與引發(fā)體,介鏈酶等構(gòu)成一個(gè)復(fù)制體(replisome)。由于復(fù)制體的存在,先導(dǎo)鏈和隨從鏈可以同時(shí)復(fù)制。DNa polⅢ是由多亞基組成的不對(duì)稱二聚體,它可能同時(shí)負(fù)責(zé)先導(dǎo)鏈和隨從鏈的復(fù)制,在φ×174的復(fù)制中觀察到引發(fā)體總是伴隨著DNA嚕噗(loop)的存在。圖16?2可以看到,由于隨從鏈的模板DNA在DNA聚合酶Ⅲ全酶上繞轉(zhuǎn)了180°而形成一個(gè)嚕噗,因此崗崎片段的合成方向能夠與先導(dǎo)鏈的合成方向以及復(fù)制體移動(dòng)方向保持一致。