由于在免疫學發(fā)展的早期形成了牢固的抗感染免疫的概念，以及模板學說的影響，使人們對機體免疫性的認識存在片面性，也使免疫學的進一步發(fā)展受到束縛。把機體免疫反應性視為單純的化學過程，還是生物學過程？機體免疫反應是對外源抗原的特有反應，還是機體對“自己”與“非己”識別的普遍生物學現象？這是從認識免疫現象開始就存在著的分歧。由于近代免疫生物學的進展和細胞系選擇學說的提出，才使這些問題獲得比較正確的解答。同時對生物機體的免疫反應性也有了比較全面的認識，這一時期自20世紀中至60年代有下述一些主要發(fā)現。
1．細胞轉移遲發(fā)型超敏性的成功Koch在發(fā)現結核桿菌之后，企圖用結核桿菌給患者皮下再感染以期達到免疫治療的目的，結果相反，卻引起局部組織壞死，稱之為Koch現象。這一現象具有特異性但與抗體產生無關。直到Chase 等人(1942)對Koch現象進行了深入研究，證明用致敏豚鼠血清轉移給正常動物不能引起結核菌素反應，而用細胞轉移則能引起陽性反應。首先證明了結核菌素反應不是由抗體引起，而是由致敏細胞引起，從而證明了機體免疫性除能產生體液免疫外還能形成細胞免疫。醫(yī)學.全在.線www.med126.com
2. 免疫耐受現象的發(fā)現Owen(1945)發(fā)現自異卵雙生的二頭小牛個體內有二種血型紅細胞共存，稱之為血型細胞鑲嵌現象。這種不同血型細胞，在彼此體內互不引起免疫反應，把這種現象稱之為天然耐受。這是一個重要的發(fā)現，同時也提出一個耐人深思的問題。為什么在胚胎期接受異種抗原刺激，不引起免疫反應而形成免疫耐受現象？Burnet從生物學角度提出了一種假說說明這個現象。他認為宿主淋巴細胞有識別“自己”與“非己”的能力。如在機體免疫功能成熟之前引入異物，可作為“自己”成分加以識別，故在成體后對該異物即不引起免疫反應。其后Billingham和Medawar等人（1953)在小鼠體內成功地進行了人工誘導耐受實驗，給予Burnet學說以有力支持。自此經典免疫學的觀點受到嚴重挑戰(zhàn)，人們開始注意研究免疫生物學問題了。使免疫學的發(fā)展進入了一個新的時期，即免疫生物學時期。
3．抗體生成克�。ɑ蚣毎�)選擇學說的提出 澳大利亞免疫學家Burnet以生物學及分子遺傳學的發(fā)展為基礎，在Ehrlich側鏈學說和Jerne等天然抗體選擇學說的影響下，以及人工耐受誘導成功的啟發(fā)下，于1958年提出了關于抗體生成的克隆選擇學說。這一學說的基本觀點是把機體的免疫現象建立在生物學的基礎上，他的基本觀點如下：①認為機體內存在有識別多種抗原的細胞系，在其細胞表面有識別抗原的受體；②抗原進入體內后，選擇相應受體的免疫細胞使之活化、增殖最后成為抗體產生細胞及免疫記憶細胞；③胎生期免疫細胞與自己抗原相接觸則可被破壞，排除或處于抑制狀態(tài)，因之成體動物失去對“自己”抗原的反應性，形成天然自身耐受狀態(tài)，此種被排除或受抑制的細胞系稱為禁忌細胞系；④免疫細胞系可突變產生與自己抗原發(fā)生反應的細胞系因之可形成自身免疫反應。
此學說不僅闡明了抗體產生機制，同時對許多重要免疫生物學現象都做了解答。如對抗原的識別、免疫記憶的形成、自身耐受的建立以及自身免疫的發(fā)生等現象。此學說已被免疫學者所接受，促進了現代免疫學的發(fā)展。
4．免疫學技術的發(fā)展 在此期間改進了血清學技術，建立了間接血凝反應，以及免疫標記技術等，大大促進了免疫學基礎理論研究和臨床應用。
