《哈爾濱醫(yī)科大學學報》雜志社創(chuàng)刊于1951年，是由黑龍江省教育廳主管、哈爾濱醫(yī)科大學主辦、《哈爾濱醫(yī)科大學學報》編輯部承辦的醫(yī)學綜合性學術刊物。主編：楊寶峰校長。該刊的欄目設置為：論著（基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、預防醫(yī)學)，經(jīng)驗交流，技術與方法，綜述等。

　　《哈爾濱醫(yī)科大學學報》雜志社主要刊登：哈爾濱醫(yī)科大學教師、研究生、醫(yī)務人員、科研人員及海內(nèi)外校友在科研、醫(yī)療和邊緣學科等領域的研究成果及綜述性文章。《學報》曾先后獲得全國高等學校自然科學學報優(yōu)秀編輯質(zhì)量三等獎；全國高等醫(yī)學院校學報質(zhì)量二等獎；全國優(yōu)秀科技期刊三等獎；全國高校自然科學學報及教育部優(yōu)秀科技期刊三等獎；全國高校優(yōu)秀科技期刊二等獎；黑龍江省高等學校自然科學學報優(yōu)秀編輯質(zhì)量一等獎；黑龍江省優(yōu)秀科技期刊二等獎；《中國學術期刊（光盤版)檢索與評價數(shù)據(jù)規(guī)范》執(zhí)行優(yōu)秀獎。2001年成為“中國期刊方陣雙效期刊”。2004年被編入《中文核心期刊要目總覽》（第四版)。

　　《哈爾濱醫(yī)科大學學報》雜志社已被《中國科學引文數(shù)據(jù)庫》、《萬方數(shù)據(jù)-數(shù)字化期刊群》、《中國科技期刊精品數(shù)據(jù)庫》、《中國學術期刊（光盤版)數(shù)據(jù)庫》、《中國學術期刊綜合評價數(shù)據(jù)庫》、《中文生物醫(yī)學期刊數(shù)據(jù)庫》、《中文科技期刊數(shù)據(jù)庫》、《中國醫(yī)學文摘》（7個分冊)等收錄。

　　《哈爾濱醫(yī)科大學學報》雜志社主要欄目：論著（基礎醫(yī)學、臨床醫(yī)學、預防醫(yī)學)，經(jīng)驗交流，技術與方法，綜述。