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復(fù)雜DNA甲基化指紋的制備方法

公開(公告)號 CN1253582C  
公開(公告)日 2006.04.26  
申請(專利)號 CN98812738.5  
申請日期 1998.11.27  
專利名稱 復(fù)雜DNA甲基化指紋的制備方法  
主分類號 C12Q1/68(2006.01)I  
分類號 C12Q1/68(2006.01)I  
分案原申請?zhí)?  
優(yōu)先權(quán) 1997.11.27 DE 19754482.7  
申請(專利權(quán))人 EPI基因組股份公司  
發(fā)明(設(shè)計)人 A·歐萊克;S·S·歐萊克;J·沃爾特  
地址 德國柏林  
頒證日  
國際申請 1998-11-27 PCT/DE1998/003558  
進入國家日期 2000.06.28  
專利代理機構(gòu) 中國國際貿(mào)易促進委員會專利商標(biāo)事務(wù)所  
代理人 樊衛(wèi)民  
國省代碼 德國;DE  
主權(quán)項 組織和細(xì)胞型的表征、分類和鑒別方法,用于對組織和細(xì)胞群行為的預(yù)測,并用于對具有改變表達的基因的鑒定,其特征在于:在從任一組織樣品中獲得的、未受處理、經(jīng)受剪切或通過限制性內(nèi)切核酸酶切割的基因組DNA中,將堿基胞嘧啶而不是5-甲基胞嘧啶經(jīng)亞硫酸氫鹽溶液處理轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,利用極短寡核苷酸或簡并性寡核苷酸或互補于連接體寡核苷酸的寡核苷酸,擴增這樣處理的基因組DNA的級分,其中極短寡核苷如此短以致于超過100個不同片段得到擴增,其中簡并性寡核苷酸含有如此多的簡并位置,使得擴增中超過100個不同片段得到擴增,其中連接體寡核苷酸在亞硫酸氫鹽處理之前已與切割或剪切的基因組DNA的末端連接,得自擴增級分的富含鳥嘌呤DNA鏈上剩余的胞嘧啶,和/或得自擴增級分的富含胞嘧啶DNA鏈上的鳥嘌呤的量通過雜交或聚合酶反應(yīng)檢測,藉此實現(xiàn)其表征、分類和鑒別。  
摘要 本發(fā)明涉及一種用于組織和細(xì)胞型的表征、分類和鑒別,對組織和細(xì)胞群行為的預(yù)測,并用于對具有改變表達的基因的鑒定的方法。該方法,其特征在于:在從任何組織樣品中獲取的基因組DNA中,堿基胞嘧啶(而不是5-甲基胞嘧啶)經(jīng)亞硫酸氫鹽溶液處理轉(zhuǎn)化為尿嘧啶。利用極短的或簡并寡核苷酸擴增這樣處理的基因組DNA的部分。通過雜交或聚合酶反應(yīng)檢測擴增片段的剩余胞嘧啶。該分析所產(chǎn)生的、可自動適用于處理算法的數(shù)據(jù)的量可用于得出關(guān)于所分析細(xì)胞物質(zhì)的表型的結(jié)論。  
國際公布 1999-06-10 WO1999/028498 德  
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