中國科學(xué)院武漢病毒研究所座落在武漢市風(fēng)景秀麗的東湖之濱，始建于1956年，是從事病毒學(xué)研究的綜合性研究機構(gòu)。
武漢病毒研究所于2002年進入中國科學(xué)院知識創(chuàng)新工程試點序列。根據(jù)新時期的辦院方針，將戰(zhàn)略定位和發(fā)展目標確定為：面對國家農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展、人口健康和國家安全的戰(zhàn)略需求；面向病毒學(xué)研究領(lǐng)域的國際前沿，加強原始科學(xué)創(chuàng)新，加強關(guān)鍵技術(shù)創(chuàng)新與集成，攀登病毒學(xué)研究的科學(xué)高峰，為我國農(nóng)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展、人口健康和國家安全作出基礎(chǔ)性、戰(zhàn)略性和前瞻性貢獻。將病毒所建成我國相關(guān)領(lǐng)域的重要研究基地、高層次人才培養(yǎng)基地、科學(xué)知識傳播基地。學(xué)科布局上以病毒學(xué)為核心，重點開展農(nóng)業(yè)病毒（農(nóng)業(yè)微生物)和醫(yī)學(xué)病毒的研究。通過研究病毒與宿主的相互作用關(guān)系，發(fā)展病毒（微生物)的控制與利用技術(shù)。將分析生物技術(shù)作為研究所的技術(shù)平臺，通過規(guī)模分析技術(shù)和分子酶工程學(xué)等前沿研究，發(fā)展適用于病毒學(xué)基礎(chǔ)研究和實際應(yīng)用的分析生物技術(shù)。通過國家目標與學(xué)科前沿的有機結(jié)合，形成一種以國家目標帶動基礎(chǔ)研究的特色研究模式，為我國農(nóng)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展、人口健康和國家安全作出貢獻。
病毒所現(xiàn)有科研機構(gòu)包括分子病毒學(xué)研究室、生物防治研究室、分析病原微生物學(xué)研究室、中國病毒資源保藏與信息中心；一個國家重點實驗室：病毒學(xué)國家重點實驗室；一個國際聯(lián)合開放實驗室：中、荷、法無脊椎動物病毒學(xué)聯(lián)合開放實驗室。
分子病毒學(xué)研究室：面向我國人口健康、農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展及國家安全的戰(zhàn)略需求，面向病毒學(xué)領(lǐng)域的科學(xué)前沿，利用分子病毒學(xué)及現(xiàn)代生物技術(shù)的研究手段，從病毒基因、基因組、病毒與宿主的相互作用等不同層次，研究病毒感染的分子過程及其伴隨的生命現(xiàn)象，揭示病毒感染及其與宿主相互作用的分子機理，發(fā)展分子病毒學(xué)理論基礎(chǔ)，為我國農(nóng)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展，人口健康和國家安全提供強有力的技術(shù)支撐。主要學(xué)術(shù)方向包括人類重要病毒（如免疫缺陷病毒HIV、丙型肝炎病毒HCV、流感病毒、人類巨細胞病毒(HCMV)、腫瘤病毒KSHV等)和新生疾病病毒（如嚴重急性呼吸道綜合癥病毒SARS-CoV)的基因變異、致病性、抗病毒藥物治療和機體防御機理的基礎(chǔ)和應(yīng)用基礎(chǔ)研究。從分子流行病學(xué)，分子生物學(xué)、、基因組學(xué)、分子免疫學(xué)、抗病毒藥物篩選和耐藥性機制等方面研究病毒感染與抗感染的機理，為有效地預(yù)防和治療病毒性感染提出新思路和新方法；在農(nóng)業(yè)病毒學(xué)方面主要研究昆蟲病毒感染的分子機理、基因工程改良構(gòu)建新型高效的病毒殺蟲劑和病毒表達系統(tǒng)構(gòu)建；經(jīng)濟動物（畜禽和水產(chǎn)養(yǎng)殖動物)病毒病源的分離鑒定、致病的分子機理和防御的關(guān)鍵技術(shù)的研究。
生物防治研究室：面向我國農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展的戰(zhàn)略需求，開展有害生物防治及污染環(huán)境生物治理研究。在昆蟲病毒、殺蟲微生物、環(huán)境微生物和植物病原微生物菌種資源的基礎(chǔ)上，開展特異性基因資源的發(fā)掘，功能基因的克隆及功能基因組學(xué)研究，獲得擁有我國自主知識產(chǎn)權(quán)的特異性新菌（毒)株和新基因；通過對昆蟲分子病理、昆蟲的抗性機理、毒素殺蟲活性因子、植物病原的致病機理及其信號傳導(dǎo)分子的深入研究，為有害生物的生物防治提供新的思路和方法；開展重組微生物和轉(zhuǎn)基因植物研究，研制新型生物殺蟲劑，評估重組微生物和轉(zhuǎn)基因植物對環(huán)境的安全性影響。發(fā)展新的有害生物防治技術(shù)，建立和完善以生物防治為主的病蟲害綜合防治體系。