如果某些病原體突破了第一道和第二道防線，即進(jìn)入人體并生長繁殖，引起感染。有的有癥狀，就是患��；有的沒有癥狀，稱作隱性感染。不論是哪一種情況，機(jī)體都經(jīng)歷了一次與病原體斗爭的過程，這種專門針對(duì)某一種病原體（抗原)的識(shí)別和殺滅作用稱為特異性免疫。譬如得過傷寒病的人對(duì)傷寒桿菌有持久的免疫力，那是因?yàn)閭畻U菌刺激機(jī)體產(chǎn)生免疫應(yīng)答，增加了巨噬細(xì)胞的吞噬功能，同時(shí)在體內(nèi)還產(chǎn)生抗傷寒桿菌的抗體。人體的免疫系統(tǒng)又能把傷寒桿菌這個(gè)“敵人”的特征長期“記憶”下來，如果再有傷寒桿菌進(jìn)入，就會(huì)很快被識(shí)別、被消滅。
能進(jìn)行免疫應(yīng)答的免疫細(xì)胞有很多種，最重要的是淋巴細(xì)胞。它又分成兩種。兩種細(xì)胞的發(fā)育成熟過程不一樣，一種是在胸腺內(nèi)發(fā)育成熟，稱作T淋巴細(xì)胞，是在骨髓內(nèi)發(fā)育成熟的為B淋巴細(xì)胞。
具有吞食異物的巨噬細(xì)胞也是一種重要的免疫細(xì)胞，它具有“加工廠”的作用，即巨噬細(xì)胞吞噬異物（如細(xì)菌、腫瘤細(xì)胞等)后，對(duì)異物進(jìn)行加工處理。處理后的異物（抗原)就與T淋巴細(xì)胞和B淋巴細(xì)胞發(fā)生免疫反應(yīng)，它本身也能直接殺滅異物或者產(chǎn)生細(xì)胞因子參與免疫反應(yīng)。
B淋巴細(xì)胞受病原體刺激后，引起一系列變化，最終轉(zhuǎn)化成為能產(chǎn)生抗體的漿細(xì)胞，所產(chǎn)生的抗體通過各種方式來消滅病原體，如溶解病原體，中和病原體產(chǎn)生的毒素，凝集病原體使之成為較大顆粒讓吞噬細(xì)胞吞食消滅。漿細(xì)胞產(chǎn)生的抗體存在于機(jī)體的血液和體液中，這種免疫反應(yīng)就稱為體液免疫。
經(jīng)處理后的病原體刺激T淋巴細(xì)胞后，也同樣引起一系列變化，最終轉(zhuǎn)化成能釋放出淋巴因子的致敏淋巴細(xì)胸。淋巴因子種類很多，作用也并不相同，它們積極地參與到免疫反應(yīng)中，這種免疫反應(yīng)通常稱為細(xì)胞免疫。體液免疫和細(xì)胞免疫二者之間不是孤立的，它們相輔相成，互相協(xié)作，共同發(fā)揮免疫作用。
