當人類邁進21世紀門檻的時候，人類基因組計劃已告完成，后基因組時代已現(xiàn)端倪，生命科學的飛速進步不斷推動著人類對自身健康和疾病的認識，人口與健康領域成為國際上生命科學研究最為集中、進展最快的一個領域。同時，隨著我國經濟社會的發(fā)展,人們的生活條件和生活方式發(fā)生了深刻的變化，13億人民對健康與醫(yī)藥的戰(zhàn)略需求亟待依靠生命科學來滿足。在國家藥物與人口健康領域戰(zhàn)略需求與世界生命科學前沿發(fā)展不斷交匯的時代背景下，按照中國科學院黨組的重大決策，1999年7月中國科學院上海生命科學研究院（以下簡稱為“上海生科院”)應時代潮流的挑戰(zhàn)而誕生了。她秉承了中國科學院滬區(qū)8個生物學研究機構半個多世紀的優(yōu)良傳統(tǒng)，成為中國科學院知識創(chuàng)新工程首批試點單位之一。
上海生科院的使命是在中國建設一個國際先進水平的“藥物與人口健康自主創(chuàng)新核心”，使之成為產出“一流成果、一流效益、一流管理、一流人才”的生命科學研究機構，促進我國生物技術產業(yè)發(fā)展基地，以及生命科學與生物技術高級人才培養(yǎng)基地。在我國藥物與人口健康自主創(chuàng)新體系中發(fā)揮骨干引領和示范帶動作用，為提高我國疾病防控能力、人民健康水平、促進醫(yī)藥產業(yè)發(fā)展不斷做出基礎性、戰(zhàn)略性和前瞻性的重大創(chuàng)新貢獻。
上海生科院成立7年來，一直按照中科院黨組的精神全力以赴地建設著這個核心基地:
——運用整合、新建、轉制、搬遷等各種研究機構深化改革方式，完成了原來8個生物學研究機構的體制改革和結構調整，組成4個研究所和1個轉制企業(yè)；在中科院的支持下又適時地進行新的戰(zhàn)略布局，以幾乎是一年一個的速度新建了4個研究所和1個多學科交叉研究中心；
——凝練提升了科技創(chuàng)新目標，調整了學科布局和科研結構，吸引、凝聚和培養(yǎng)了一批高水平科技人才，造就了一支具有創(chuàng)新能力的科技隊伍；
——大力推進跨所合作和國際國內合作，推進原始創(chuàng)新，實施以知識產權產生、保護、經營和管理為核心的技術轉移戰(zhàn)略，科研事業(yè)快速健康發(fā)展，科技自主創(chuàng)新能力顯著提升，取得了一批原始創(chuàng)新成果；
——以人為本大力推進創(chuàng)新文化建設，樹立“以科教興國為己任，以創(chuàng)新為民為宗旨”的科技價值觀，倡導“礪志求真，篤學明德”的核心理念，率先推行科研道德行為準則，營造了以“合作交流”為底蘊、有利于科技創(chuàng)新的文化氛圍。
7年來，我們始終堅持正確處理改革、發(fā)展與穩(wěn)定的關系，把有利于科研、有利于人才培養(yǎng)和使用、有利于為國家經濟社會發(fā)展作貢獻的“三個有利于”作為一切工作方針的判據(jù)，針對發(fā)展的不同階段和具體環(huán)境條件，先后提出和實施了相應的工作總方針，起步期實行“對內穩(wěn)固，對外拓展”，鞏固期實行“鞏固、提升，合作、交叉”，跨越期將實行“抓基地，建平臺，創(chuàng)一流”。
上海生科院是由原中國科學院上海生物化學研究所、上海細胞生物學研究所、上海生理研究所、上海腦研究所、上海藥物研究所、上海植物生理研究所、上海昆蟲研究所和上海生物工程研究中心等8個生物學研究機構經過結構調整、體制創(chuàng)新而組建成立的。中國科學院國家基因研究中心、上海生命科學研究中心、中國科學院上海實驗動物中心、中國科學院上海文獻情報中心等也先后整建制并入。上海生命科學研究院的學術傳統(tǒng)、學術積淀有著50多年的歷史，這里人才輩出，誕生過世界生命科學史上具有里程碑意義的成果——世界上首次全人工合成結晶牛胰島素、酵母丙氨酸轉移核糖核酸，創(chuàng)制了我國第一個被國際公認的創(chuàng)新藥物“蒿甲醚”，首次完成蟾蜍卵母細胞的人工單性繁殖等。有關研究所還曾率先在國內開展以基因工程為主的現(xiàn)代生物技術研究。
撫今追昔，我們無限景仰前輩賢哲在這里開創(chuàng)現(xiàn)代生命科學研究事業(yè)的遠見卓識，欽佩幾代科學家在這里的開拓耕耘，感謝歷屆院所領導、全院同仁和研究生為上海生命科學研究院改革、建設和發(fā)展所做出的無私奉獻！
上海生科院現(xiàn)有8個研究所和4個支撐單元，分別是生物化學與細胞生物學研究所、神經科學研究所、藥物研究所、植物生理生態(tài)研究所、健康科學研究所、營養(yǎng)科學研究所、上海巴斯德研究所和中科院－馬普計算生物學伙伴研究所，以及中國科學院上海生命科學信息中心、中國科學院上海交叉學科研究中心、上海中科伍佰豪生物工程研究發(fā)展有限公司、上海實驗動物中心。她已經成為了我國生命科學領域大型綜合性國立研究機構。
上海生科院聚焦科技創(chuàng)新活動于以下重點研究領域：功能基因組、蛋白質組和生物信息學，生物大分子的結構、相互作用及功能，細胞活動的分子網絡調控，腦發(fā)育與腦功能的分子與細胞機制，防治重要疾病的新藥研究開發(fā)、中藥現(xiàn)代化以及藥物研究的理論和方法，植物分子生理和植物與環(huán)境的相互作用，生物技術的創(chuàng)新和應用，生物醫(yī)學轉化型研究，現(xiàn)代營養(yǎng)科學，病毒學與免疫學，計算生物學，以及生命科學與其他學科的交叉。
在知識創(chuàng)新工程三期，上海生科院將圍繞建設“藥物與人口健康自主創(chuàng)新核心”，跨所部署創(chuàng)新藥物、重大疾病診治、生物技術產品研究等三大研究計劃，建設和完善創(chuàng)新藥物研發(fā)、疾病系統(tǒng)生物學研究、工業(yè)生物技術研發(fā)等三大技術平臺。
——創(chuàng)新藥物研究計劃瞄準“出新藥”目標，將針對嚴重影響我國人民健康的重大疾病建立完整的藥物創(chuàng)新體系；重大疾病診治研究計劃將開展疾病的發(fā)病機理、新診斷標記物、預防與干預研究等，為疾病的診斷和防治提供新思路、新手段、新途經；生物技術產品研究計劃將重點研發(fā)生物類藥、營養(yǎng)干預、生物質能源和醫(yī)用原料等。目前，圍繞“三大研究計劃”已經優(yōu)選了8個重大研究方向，即創(chuàng)新藥物研發(fā)，中藥現(xiàn)代化，干細胞的研究與應用，糖尿病的發(fā)病機理與防治，神經退行性疾病的發(fā)病機理與防治，艾滋病等新生傳染性疾病的發(fā)病機理與防治，腫瘤的發(fā)病機理與防治，工業(yè)微生物的研究與應用等。
——創(chuàng)新藥物研發(fā)平臺將進一步完善國家新藥篩選中心、藥物發(fā)現(xiàn)與設計中心、中藥現(xiàn)代化中心等，重點建設藥效評價中心、藥物代謝中心、安全性評價中心、分析中心，建設藥物制劑中心、藥物質量控制中心等；疾病系統(tǒng)生物學研究平臺將進一步提高基因組平臺、蛋白質組研究平臺、生物信息學研究平臺的技術支撐能力，新建代謝組研究平臺和計算生物學平臺，實現(xiàn)各組學研究的對接；工業(yè)生物技術研發(fā)平臺將完善和建設基因克隆表達平臺、動物細胞表達平臺、多肽合成平臺、工業(yè)微生物發(fā)酵平臺、生物催化與轉化平臺、抗體平臺和蛋白質分離純化平臺等。
重點實驗室是聚集高水平科技人才，開展科學前沿探索，貢獻科技創(chuàng)新成果的重要基地�，F(xiàn)有3個國家重點實驗室：分子生物學國家重點實驗室，新藥研究國家重點實驗室，植物分子遺傳國家重點實驗室；4個中國科學院重點實驗室：分子細胞生物學重點實驗室，神經生物學重點實驗室，蛋白質組學重點實驗室，干細胞重點實驗室。
