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基因定位

  基因組是生物的生殖細(xì)胞中所含全部基因的總和。人類基因組具有極其復(fù)雜的結(jié)構(gòu),其編碼蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因大約有100 000個,每個單倍體DNA含有3.2×109 bp,分布在24條常染色體和X,Y性染色體上。此外,還含有大量的非編碼的重復(fù)DNA序列;蚨ㄎ唬╣ene location)是用一定的方法將基因確定到染色體的實際位置。這是現(xiàn)代遺傳學(xué)的重要研究內(nèi)容之一。將不同的基因確定于染色體的具體位置之后,即可繪制出基因圖(gene map)。

  有兩種基本方式制作人類染色體的基因圖:即物理作圖和遺傳作圖。物理作圖(physical mapping)是從DNA分子水平制作基因圖。它表示不同基因(包括遺傳標(biāo)記)在染色體上的實際距離,是以堿基對為衡量標(biāo)準(zhǔn),所以物理圖譜(physical map)最終是以精確的DNA堿基對順序來表達(dá),從而說明基因的DNA分子結(jié)構(gòu)。從細(xì)胞遺傳學(xué)水平,用染色體顯帶等技術(shù)在光學(xué)顯微鏡下觀察,將基因定位不同染色體的具體區(qū)帶,又稱區(qū)域定位(regiona assignmer),而把基因只定位到某條染色體上稱為染色體定位(chromosomal assignment)。這個水平上的基因圖譜又稱細(xì)胞遺傳圖(cytogenetical map)。分辨率可達(dá)5Mb至1Mb。遺傳作圖(genetic mapping)是以研究家族的減數(shù)分裂,以了解兩個基因分離趨勢為基礎(chǔ)來繪制基因座位間的距離,它表明基因之間連鎖關(guān)系和相對距離,并以重組率來計算和表示,以厘摩(cM)為單位。兩個遺傳座位間1%的重組率即為1厘摩。人類精細(xì)的遺傳圖水平可達(dá)1cM即100kb(1Mb)左右。

  根據(jù)系譜分析和少數(shù)血型分析,就可確定某些基因位于X染色體上。X連鎖關(guān)系確定后,再依重組率計算兩者之間的相對距離,便可將兩個基因定位于XX染體的相對位置上,1961年紅綠色就是通過這種方法定位于X染色體上。

  1968年Donahue依據(jù)系譜分析的原理,第一次將Duffy血型基因定位于第1號常染色體上。它在中期染色體時,發(fā)現(xiàn)1號染色體長臂1區(qū)的異染色質(zhì)區(qū)有變異特征。繼后,他發(fā)現(xiàn)在一些家族中,凡是具有這種形態(tài)特征的染色體都是Duffy血型者,從而將此血型的基因定位于第1號染色體上。伴隨分子生物學(xué)和細(xì)胞分子遺傳學(xué)的進(jìn)展,基因定位的新方法不斷出現(xiàn),特別是體細(xì)胞雜交、分子雜交、DNA重組和DNA體外擴(kuò)增(PCR)等技術(shù)后出現(xiàn)與應(yīng)用,產(chǎn)生了許多定位新技術(shù),如脈沖場凝膠電泳、染色體顯微攝影、染色體步移和酵母人工染色體(YAC)克隆等,使基因定位的研究工作得到迅速發(fā)展。醫(yī)學(xué)在線www.med126.com

  自1973年第一次國際人類基因組制圖(human genome mapping,HGM)會議召開以來,每隔2-3年就舉行一次會議。在第一次HGM會議上,人類基因定位只有31個,而今迅速進(jìn)展到已定位的基因4000多個,而且有一大批克隆基因和DNA遺傳標(biāo)記被定位,如表7-1所示。這些成果有力地推動了遺傳咨詢、基因診斷和基因治療的進(jìn)展,對醫(yī)學(xué)理論和臨床實踐的發(fā)展起著十分重要的作用。

表7-1 HGM會議定位的克隆基因和DNA多態(tài)標(biāo)記

 

HGM11(1999年)

CCM(1992年)

HGM12/CCM93(1993年)

基因總數(shù)

克隆基因

多態(tài)標(biāo)記

2778

1524

622

3301

713

4183

3808

850

DNA節(jié)段總數(shù)

多態(tài)標(biāo)記

克隆DNA

6974

2608

9760

12376

3250

16277

25640

5114

29833

多態(tài)標(biāo)記總數(shù)

微衛(wèi)星

3230

312

3963

812

5964

2427

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