Ig重鏈基因是由V、D、J和C四種不同基因片段所組成。
(一)Ig重鏈可變區(qū)(V區(qū))基因
重鏈可變區(qū)基因是由V、D、J三種基因片段經(jīng)重排后所形成。
1.重鏈V區(qū)基因的組成 編碼重鏈V區(qū)基因長(zhǎng)約1000~2000kb,包括V、D、J三組基因片段。
(1)重鏈V基因片段:小鼠VH基因片段數(shù)目為250~1000個(gè)。根據(jù)VH基因片段核酸序列的相似性(>80%同源性),至少可分為11個(gè)家族(family).人V基因片段約為100個(gè),至少可分為6個(gè)家族,每個(gè)家族含有2~60個(gè)成員不等。V基因片段由2個(gè)編碼區(qū)(coding regions)組成:第一個(gè)編碼區(qū)編碼大部分信號(hào)序列;第二個(gè)編碼區(qū)編碼信號(hào)序列羧基端側(cè)的4個(gè)氨基酸殘基和可變區(qū)約98個(gè)氨基酸殘基,包括互補(bǔ)決定區(qū)1和2(complementarity determining region 1和2,CDR1和CDR2)。
。2)重鏈D基因片段:D(diversity)是指多樣性。DH基因片段僅存在于重鏈基因中而不存在于輕鏈基因。D基因片段編碼重鏈V區(qū)大部分CDR3。小鼠DH共有12個(gè)片段,位于VH和JH基因片段之間,大部分DH片段較為集中,約占60~80kb,但靠上游的DH可能位于VH區(qū)域內(nèi),最后一個(gè)DH片段與JH基因5'端相距約0.7kb。人類DH片段可能有10~20個(gè)左右。
(3)重鏈的J基因片段:J(joining)指連接,是連接V和C基因片段。JH編碼約15~17個(gè)氨基酸殘基,包括重鏈V區(qū)CDR3除DH編碼外的其余部分和第4骨架區(qū)。小鼠JH基因片段有4個(gè),與Cμ相距約6.5kb。人有9個(gè)JH,其中6個(gè)是有功能的JH基因片段。
V、D、J基因片段經(jīng)重組連接在一起,組成2個(gè)外顯子,一個(gè)外顯子編碼信號(hào)序列的大部分,另一個(gè)外顯子編碼信號(hào)序列的其余部分和重鏈可變區(qū)。
小鼠和人在胚系中Ig基因的結(jié)構(gòu)見圖3-4和圖3-5。
2.重鏈可變區(qū)基因的移位 在重鏈基因重排開始時(shí),二條染色體上都發(fā)生D基因片段移位到J基因片段而發(fā)生D-J基因連接。在此以后,只有其中一條染色體上的V基因片段與D-J基因片段連接。VH基因片段5'端含有啟動(dòng)子(promoter),JH和Cμ基因片段之間的內(nèi)含子中含有轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子(transcriptinal enhancer)。如果一條染色體VH基因與D-J基因重排無效(non-productive),另一條染色體的VH基因片段開始發(fā)生移位,與D-J基因片段連接。
某些與Ig基因片段重排有關(guān)的特殊序列稱為識(shí)別序列(recognition sequences),位于V基因片段的3'端與J基因片段的5'端之間以及D基因片段的兩側(cè)。V基因片段3'端、J基因片段5'端以及D基因片段的兩側(cè)也是DNA重排識(shí)別信號(hào)所在區(qū)域,這些識(shí)別信號(hào)包括三部分:(1)高度保守的回文結(jié)構(gòu)的七聚體(palindromic heptamer);(2)較少保守、富含A/T的九聚體(nonamer);(3)七聚體和九聚體之間不保守的間隔序列(spacer sequence),含有12±1堿基對(duì)或23±1堿基對(duì)。根據(jù)12/23堿基對(duì)間隔規(guī)則(或稱1圈/2圈定律),兩個(gè)基因片段的重組僅發(fā)生在兩個(gè)基因片段之間:各有一個(gè)12個(gè)堿基對(duì)片段和一個(gè)23個(gè)堿基對(duì)片段的結(jié)構(gòu)(圖3-6)。
圖3-4 小鼠Ig基因結(jié)構(gòu)
注:(1)L:先導(dǎo)序列基因片段 V:可變區(qū)基因片段 D:D基因片段
J:J基因片段 C:恒定區(qū)基因片段 E:轉(zhuǎn)錄增強(qiáng)子
S:轉(zhuǎn)換區(qū) *:假基因
。2)內(nèi)含子區(qū)域所標(biāo)數(shù)字表示DNA長(zhǎng)度(kb)。
。3)每個(gè)CH基因用一個(gè)方框表示,實(shí)際上包括幾個(gè)外顯子,如Cμ含有6個(gè)外顯子。
。4)λ基因增強(qiáng)子位于Cλ4和Cλ1基因片段的下游。
圖3-5 人Ig基因結(jié)構(gòu)
注:(1)L:先導(dǎo)序列基因片段 V:可變區(qū)基因片段 D:D基因片段
J:J基因片段 C:恒定區(qū)基因片 *:假基因
。2)內(nèi)含子區(qū)域所標(biāo)數(shù)字表示DNA長(zhǎng)度(kb)
。3)每個(gè)CH基因用一個(gè)方框表示,實(shí)際上包括幾個(gè)外顯子
參與V/(D)/J基因重組過程的酶稱為V/(D)/J重組酶(recombinase),有關(guān)于執(zhí)行識(shí)別、切割和重新連接基因片段重組酶的純化和鑒定工作還剛開始。重組酶實(shí)際上包括重組過程中多種酶的活性。最近在前B細(xì)胞(pre-b cell)中已經(jīng)鑒定出兩種刺激Ig基因重排的基因,稱為重組激活基因1(recombination activating gene 1,RAG-1)和重組激活基因2(RAG-2),其確切的作用機(jī)理還不太清楚。重組酶作用的特點(diǎn)是:(1)淋巴細(xì)胞特異性的,非淋巴樣細(xì)胞如成纖維細(xì)胞無重組酶活性,這可能解釋了Ig基因的重排僅見于B淋巴細(xì)胞。目前一般認(rèn)為T細(xì)胞TCR基因重排中的重組酶與B細(xì)胞中重組酶相同或相似。(2)重組酶發(fā)揮其功能僅限于B細(xì)胞發(fā)育早期,未成熟B細(xì)胞如前B細(xì)胞(pre-b cell)細(xì)胞系重組酶活性很高,但抗體生成細(xì)胞或骨髓瘤細(xì)胞無明顯重組酶活性,因此時(shí)B細(xì)胞已經(jīng)分泌某一特異性抗體,不再發(fā)生重排其它的Ig基因,因此也不會(huì)改變?cè)人a(chǎn)生抗體的特異性。轉(zhuǎn)換重組酶(switch recom-binase)可能與VDJ重組酶(VDJ recombinase)相似,但缺乏七聚體/九聚體(heptamer/nonamer)識(shí)別蛋白。重組酶功能異常可導(dǎo)致機(jī)體不能產(chǎn)生Ig和TCR,很可能與重癥聯(lián)合免疫缺陷(severe combined immunodeficiency,SCID)的發(fā)生有關(guān)。例如SCID小鼠16號(hào)染色體著絲點(diǎn)末端存在一個(gè)scid基因,為單基因常染色體遺傳基因。scid基因純合將影響DNA重組酶的識(shí)別功能,在TCR或BCR基因片段重排時(shí)不能識(shí)別正確的位點(diǎn),使T細(xì)胞、B細(xì)胞在淋巴干細(xì)胞發(fā)育早期即夭折,導(dǎo)致重癥聯(lián)合免疫缺陷。
圖3-6 參與Ig基因重排組酶識(shí)別的DNA序列